北京大学第六医院门诊设有普通门诊、专家门诊、特需门诊、中西医结合门诊、神经内科门诊、多专家会诊以满足不同层次、不同问题患者的就诊需求;还设有进食障碍、成瘾行为、睡眠障碍、记忆障碍、行为分析治 疗、精神疾病康复咨询、心理、老年儿童等相关专业门诊，以满足就诊者对专科或特殊方向的咨询和治 疗需求。
2014年10月23日，北京大学第六医院被科技部、国家卫健委和总后勤部卫生部正式认定为国家精神心理疾病临床医学研究中心。由北京大学第六医院牵头并联合北京大学心理与认知科学学院、中国依赖性研究所等共建单位共同组建的国家精神心理疾病临床医学研究中心，旨在针对临床研究瓶颈问题，开拓临床研究创新体系，建立以多目标、多任务研究方案为基础的新型临床研究模式;构建规范化、高质量的协同研究网络和多中心研究平台，开展多中心、大规模、高质量的精神心理疾病临床研究，提高全国精神心理疾病预防、诊断、治 疗和康复的综合服务水平，切实解决临床关键问题。
从实习医生到主任医师，刘琦医生已经在北大六院工作了二十多年。每日查房看患者、调整方案、日常带教、出门诊以及作为科室副主任承担一些科室管理工作，她的工作十年如一日。病房的住院医三个月或六个月轮转一次，经她带教的住院医也有几百个了，几乎没有住院医不喜欢她。
在儿童精神病学领域，致力于注意缺陷多动障碍(ADHD)和相关破坏行为问题的病因及发病机制、治 疗、预后和成人期ADHD的系列研究，开展儿童孤独症、创伤后应激障碍、儿童精神分裂症等儿童期重要精神障碍的临床与应用基础研究， 先后承担国家自然科学基金、科技部“十一五”支撑计划、973计划、国家重点研发计划、原卫生部、教育部、北京市科委等多项基金课题，在病因学、临床评定和治 疗方面均取得较为突出的成绩。