北京大学第六医院门诊设有普通门诊、专家门诊、特需门诊、中西医结合门诊、神经内科门诊、多专家会诊以满足不同层次、不同问题患者的就诊需求;还设有进食障碍、成瘾行为、睡眠障碍、记忆障碍、行为分析治 疗、精神疾病康复咨询、心理、老年儿童等相关专业门诊，以满足就诊者对专科或特殊方向的咨询和治 疗需求。
北大六院于2003年开始建立无抽搐电休克室，经过了十多年的发展，已经成为我院的重点科室之一，迄今为止，已经完成5万人次患者的，取得很好的效果。我院拥有一支具有丰富临床经验的MECT团队，包括：科主任1名，副主任医师1名，主治医师2名，麻醉科医师2名，主管护师2名，护师1名，护士1名。我院拥有世界一 流的仪器设备。
“抑郁症伤害所有年龄的人群，不论是学生还是工作人群、或者老年人。从预防的角度，可以在学校、工会、社区等多层次开展科普、筛查，尤其是对有症状的人群能够提供相对便利的医疗服务，提高就诊率和率，降低抑郁症的危害。此外，部分抑郁症在医院治 疗后期，还需要进行系统的康复治 疗、心理治 疗，也需要互助能够预防之后的复发。这些活动也需要得到政府和社会组织的大力支持。”刘琦说。
北京大学第六医院的老院（简称“北大六院”）坐落在花园北路，和旁边的北医三院相比，显得十分狭小。然而，这里却是精神专科医院的医院之一，收治来自全国的精神科疑难杂症，也是临床医学生进一步选择精神科专业的学习首府。