北京宣武医院神经科学各分支不断发展壮大：神经内科和神经外科是重点学科，共三次获得国家科技进步二等奖；功能神经外科与运动障碍病中心被国际机构命名为“卓 越成就临床中心”，是国内该领域的领军团队。
北京宣武医院持续秉承“全生命周期管理理念”，着力推动国家医学中心、国家医学转化中心、国家重点实验室建设，包括互联网医疗诊治技术国家工程中心、神经变性病教育部重点实验室、中国国际神经科学研究所、北京功能神经外科研究所等，承担着多项国家攻关课题，科技部863、973课题、国家科技重大专项、国家重点研发计划。
神经重症监护病区在脑损伤监测与评估系统建立和脑损伤早期神经保护体系开发、重症患者救治等方面优势突出。设在北京宣武医院神经内科的北京市神经内科疑难病会诊中心汇集了我国该领域学者，为来自海内外的疑难病患者提供权 威的诊断和治 疗。
1988年开始住院医师培训工作，2015年成为北京市住院医师规范化培训十佳基地，每年住院医师结业考核通过率位居北京市前列，获得全国十佳培训基地管理者、基地负责人、全国专业基地主任。学院每年完成国 家级、市级继续教育项目110余项，多次获评北京市继续教育先进集体。