总比较：内资设立涉及部门：工商局、国税局、地税局、质监局、公安局、环保局、公安消防局、
外资设立涉及部门：工商局、国税局、地税局、质监局、公安局、环保局、公安消防局、
外汇局、商务部、财政局、海关、贸工局、市政府
以上部门不一定全部涉及：主要看企业是否是生产加工型还是销售贸易型，对于外资企业来说还要看是
港澳台、还是国外出资的
一：名称预审（工商局）
⑴（不同）起名（起３－５个名字、是３个字以上的名字）内外资不同，例如：内资：深圳市ｘｘ有限公司
外资：ＸＸＸＸ（深圳）有限公司
⑵（不同）办理名称核准（所需资料：全体股东签署的企业名称核准通知书，带上股东身份证原件及复印件，所属登记机关办理。内资不收费、外资收费１００元）
二：合同章程、批准文书等审批（商务局）
⑶（不同）办理前置审批手续。外资企业一定要，涉及贸工局、财政局、政府部门等等。内资一般没有审批除特殊行业：比如烟草、药品等
三：工商执照
⑷此项相同办理房屋租赁合同（股东自有房产用途是办公、商业、厂房的可以直接办理注册或以股东名义去所属房屋租赁管理所办理租赁合同用途是办公、商业、厂房的，租赁合同后一页盖的是《深圳市ｘｘ区房屋租赁管理所"登记"专用章》可以直接办理注册）
股东自有房产用途是办公、商业、厂房的可以直接办理注册或以股东名义去所属房屋租赁管理所办理租赁合同用途是办公、商业、厂房的，租赁合同后一页盖的是《深圳市ｘｘ区房屋租赁管理所"登记"专用章》可以直接办理注册）
市内：（股东自有房产或租赁合同用途是商住、住宅的《深圳市ｘｘ区房屋租赁管理所"备案"专用章》，必须本大厦有成立业主委员会，而且已在建设局备案的业主委员会，要业主委员会出具同意注册的证明和业主委员会在建设局备案证明复印件情况下方可办理注册。）
关外：租赁合同用途是办公、商业、厂房的，租赁合同后一页盖的是《深圳市ｘｘ区房屋租赁管理所"登记"专用章》、《深圳市ｘｘ区房屋租赁管理所"备案"专用章》可以直接办理注册。关外：（股东自有房产或租赁合同用途是商住、住宅的，必须业主委员会或社区服务部或社区服务中心和物业管理处出具同意注册的证明后方可办理注册。
⑸开设银行验资账户（按股东出资比例缴股东出资款）
（所需资料：企业名称核准通知书原件、股东身份证原件和股东亲自到场）
⑹（不同）办理验资报告（深圳市会计师事务所办理）（所需资料：企业名称核准通知书、银行进帐单、公司章程、股东身份证原件）银行预留印签是签字的还需要股东在会计师事务所询证函上签字，银行预留印签是预私章的在会计师事务所询证函上盖章即可）不同：外资验资涉及外汇局与银行，而内资只要去银行
⑺准备资料提交登记机关（去所属登记机关）（所需资料：企业名称核准通知书、验资报告、公司章程、股东会决议、执行董事决议、场地使用声明、股东身份证原件、租赁合同原件。）
五个工作日后领取执照（如果法人不亲自去领取的需出具法人授权委托书方可办理）
四：公章
刻章（不必亲自去公安局办理刻章申请，可以直接委托刻章店办理）（所需资执照正副本，法人身份证原件）
五：代码办理
企业法人代码证（可以直接登陆深圳市技术监督局网上申请，网上申请时相关资料要小心填写，电话要留真实联系电话，要和营业执照信息一致，否则要正常办理第三个工作日后方可领取企业法人代码证）（所需资料：打印受理通知书盖上公章、营业执照正本、法人身份证原件、复印件如不是法人亲自去办理的要出具法人授权委托书、委托书要盖上公司公章、法人私章、和委托人身份证原件、复印件，资料备齐后去代码局可以当时办好。）
六：外汇登记、开立外汇帐户、（外资必须，内资无）人民币帐户
开设公司人民币帐户（同内资）
七：国地税
办理国地税登记（所需材料：营业执照正本、企业法人代码证、法人身份证，公司章程、、房产证或租赁合同原件及复印件加盖公章、税务登记表、办理国税时，要验资报告复印件、办理地税登记时要填写车、船、房屋信息统计表）
八：海关登记（外资必须）
九：财政登记（外资必须）
十：消防环保办理生产型必须
十一：税收
外资如果是生产性的，暂时还可以申请两免三减半（关于两免三减半：指自２００８年１月１日起，原享受低税率优惠政策的企业，在新税法施行后５年内逐步过渡到法定税率。其中：享受企业所得税１５％税率的企业，２００８年按１８％税率执行，２００９年按２０％税率执行，２０１０年按２２％税率执行，２０１１年按２４％税率执行，２０１２年按２５％税率执行；然后在相应税率的基础上减半）。税收有所优惠，内资是２５％，不过过不了多久内外资将会统一税率２５％。
十二：会计制度
大同小异，都按得中国会计准则，外资免抵退比内资多
十三：年检内外资每年都必须年检而外资年检时必须出审计报告或者验资报告，内资则不一定
外资是联合年检内资是单独年检
十四；注销外资比内资麻烦
总的来说：外资注册要麻烦些，注册费用要比内资高，注销要比内资时间久，对于１００％出口的企业来说。